蛇口中學創建于1970年，開辦時定性為兩年制高中，當時校舍尚無，租借灣廈村的一間倉庫做為校舍，吳湛擔任校長，有3名教師，他們是殷干勛、徐志華、鄭耀輝，開設一個班，有29名學生。
蛇口學校在2003年由兩所廣東省一級學校--蛇口小學(創辦于1955年)和蛇口中學(創辦于1970年)合并而成的九年一貫制學校。校園面積3萬5千平方米，建筑面積2萬1千平方米。現有59個教學班，其中小學部29個班，中學部30個班。學生人數2757人(其中小學部1389人、中學部1368人)，教職工203人。有60間教室，操場1個，體育館1間，多媒體室6間，實驗室及科學探究室8間。
